不同版本参考基因组比较

b37与hg19、GRCH37、GRCH38的区别：

hg19 vs GRCH37 vs b37

hg19来自UCSC，GRCH37来自NCBI，而我们使用的实际是GRCH37的升级版g1k b37，简称b37

GRCH37 vs b37

b37是GRCH37的升级版，在GRCH37基础上增加了一些scaffold（人的序列，但是还没有组装定位到具体的位置），一条病毒序列（疱疹病毒），一条decoy序列（hs37d5，来自BAC或者质粒克隆等，没有具体的变异检测的作用，增加比对率），并且在Y染色体上把X,Y染色体的同源区mark 成了N。

hg19 vs b37

hg19与b37的坐标系统一样，1-X,Y染色体一模一样。区别是（不考虑scaffold的区别）: 
 - 线粒体有差别（版本不一样，b37用的是修正版的NC_012920，而hg19是老版的NC_001807)
 - UCSC参考基因组中有大小写碱基，小写表示在repeat区（Repeats from RepeatMasker and Tandem Repeats Finder）
 - 染色体编号表示不同，hg19带有chr，b37直接是染色体编号

GRCH37 vs GRCH38(hg38)

GRCH38是GRCH37的升级版，具体区别可参考下面的网址：http://www.doc88.com/p-9512305171300.html

以下是各基因组之间不同与相同的说明网址，可供参考

https://wiki.dnanexus.com/Scientific-Notes/human-genome

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