公司给出的全基因组GC含量一般是用什么方法或程序测算的？

   我们QC部分给出的GC含量是通过测序得到的reads计算得到的，每个样本每条lane的GC含量为每条lane的G和C的数量总和占总的碱基数量的百分比：(G+C)/(A+T+G+C+N)*100%，为read 1 和read 2计算的平均值，每个样本的测序数据分开计算，没有标准差。

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