http://39.102.38.22/bbs/wiki/index.php?action=history&feed=atom&title=%E7%BA%AF%E5%92%8C%E5%AD%90%E5%8C%BA%E9%97%B4%EF%BC%88ROH%EF%BC%89%E6%98%AF%E6%80%8E%E4%B9%88%E5%88%86%E6%9E%90%E5%BE%97%E5%88%B0%E7%9A%84%EF%BC%9F 2026-06-17T02:08:14Z 本wiki的该页面的版本历史 MediaWiki 1.34.0 http://39.102.38.22/bbs/wiki/index.php?title=%E7%BA%AF%E5%92%8C%E5%AD%90%E5%8C%BA%E9%97%B4%EF%BC%88ROH%EF%BC%89%E6%98%AF%E6%80%8E%E4%B9%88%E5%88%86%E6%9E%90%E5%BE%97%E5%88%B0%E7%9A%84%EF%BC%9F&diff=1680&oldid=prev 2020-10-19T09:12:40Z

<p>导入1个版本</p> <table class="diff diff-contentalign-left" data-mw="interface"> <tr class="diff-title" lang="zh-Hans-CN"> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #222; text-align: center;">←上一版本</td> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #222; text-align: center;">2020年10月19日 (一) 09:12的版本</td> </tr><tr><td colspan="2" class="diff-notice" lang="zh-Hans-CN"><div class="mw-diff-empty">（没有差异）</div> </td></tr></table>

Suqingdong http://39.102.38.22/bbs/wiki/index.php?title=%E7%BA%AF%E5%92%8C%E5%AD%90%E5%8C%BA%E9%97%B4%EF%BC%88ROH%EF%BC%89%E6%98%AF%E6%80%8E%E4%B9%88%E5%88%86%E6%9E%90%E5%BE%97%E5%88%B0%E7%9A%84%EF%BC%9F&diff=1679&oldid=prev 2020-10-19T09:12:40Z

<p></p> <table class="diff diff-contentalign-left" data-mw="interface"> <tr class="diff-title" lang="zh-Hans-CN"> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #222; text-align: center;">←上一版本</td> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #222; text-align: center;">2020年10月19日 (一) 09:12的版本</td> </tr><tr><td colspan="2" class="diff-notice" lang="zh-Hans-CN"><div class="mw-diff-empty">（没有差异）</div> </td></tr></table>

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<p>导入1个版本</p> <table class="diff diff-contentalign-left" data-mw="interface"> <tr class="diff-title" lang="zh-Hans-CN"> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #222; text-align: center;">←上一版本</td> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #222; text-align: center;">2020年9月30日 (三) 02:54的版本</td> </tr><tr><td colspan="2" class="diff-notice" lang="zh-Hans-CN"><div class="mw-diff-empty">（没有差异）</div> </td></tr></table>

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<p></p> <table class="diff diff-contentalign-left" data-mw="interface"> <tr class="diff-title" lang="zh-Hans-CN"> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #222; text-align: center;">←上一版本</td> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #222; text-align: center;">2020年9月30日 (三) 02:54的版本</td> </tr><tr><td colspan="2" class="diff-notice" lang="zh-Hans-CN"><div class="mw-diff-empty">（没有差异）</div> </td></tr></table>

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<p>导入1个版本</p> <table class="diff diff-contentalign-left" data-mw="interface"> <tr class="diff-title" lang="zh-Hans-CN"> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #222; text-align: center;">←上一版本</td> <td colspan="1" style="background-color: #fff; color: #222; text-align: center;">2020年9月21日 (一) 06:49的版本</td> </tr><tr><td colspan="2" class="diff-notice" lang="zh-Hans-CN"><div class="mw-diff-empty">（没有差异）</div> </td></tr></table>

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<p></p> <p><b>新页面</b></p><div>__TOC__<br /> <br /> ROH（Runs of homozygosity ）即纯合子区域，染色体上一段连续的纯合基因区域，纯合子区域来自于共同的祖先，其长度为几万bp至几百万bp不等。纯合子区间一般都是用SNP来定位，也有用短InDel和CNV定位的。<br /> <br /> 检测纯合子区间的思路就是先找到纯合子位点，根据这些位点确定纯合子区间。我们的纯合区间是H3M2软件分析预测得到的。H3M2（homozygosity heterogeneous hidden Markov model）用隐马尔科夫模型预测ROH区间，其主要步骤如下：<br /> <br /> （1）建立BED区域：评估千人计划的WES样本SNP结果，采用10X以上的SNP计算BAF；<br /> <br /> （2）计算BAF；<br /> <br /> （3）HMM寻找ROH区间。<br /> <br /> 详情请参考如下参考文献：<br /> <br /> 参考文献：<br /> <br /> 【1】Magi, A., L. Tattini, et al. (2014). &quot;H3M2: detection of runs of homozygosity from whole-exome sequencing data.&quot; Bioinformatics 30(20): 2852-2859.<br /> <br /> 【2】Kancheva, D., D. Atkinson, et al. (2015). &quot;Novel mutations in genes causing hereditary spastic paraplegia and Charcot-Marie-Tooth neuropathy identified by an optimized protocol for homozygosity mapping based on whole-exome sequencing.&quot; Genetics in Medicine.<br /> <br /> [[分类:售后FAQ|售后FAQ]]<br /> [[分类:结题报告相关售后|结题报告相关售后]]<br /> <br /> &lt;vote type=1 /&gt; &lt;comments /&gt;</div>

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